La bioinformática se ha consolidado como una herramienta estratégica para optimizar el procesamiento de grandes volúmenes de información biológica. Esta disciplina permite anticipar amenazas aportando evidencias que permiten tomar decisiones informadas y optimizar la actividad del primer sector. En este ámbito destaca la labor de José Luis Lavín, doctor en Genética y Microbiología por la UPNA y experto en análisis de datos “Ómicos” procedentes de tecnologías de secuenciación de alto rendimiento. Con una trayectoria vinculada al Joint Genome Institute (EE.UU.) y al CIC bioGUNE, Lavín integra en el Departamento de Matemática Aplicada del centro tecnológico NEIKER el área de análisis de datos masivos y la aplicación de técnicas de aprendizaje automático (machine learning), en aras de apoyar y fortalecer la resiliencia del sector primario vasco.

 

¿Cómo explicarías qué hace un bioinformático en un centro como NEIKER y por qué es una pieza clave para el sector primario?

Actuamos como un puente entre la biología y el análisis de datos. Nuestro trabajo consiste en procesar y analizar grandes volúmenes de información biológica, como secuencias genómicas, registros de campo o históricos, para transformarlos en conocimiento práctico y aplicable. Esto es vital para el sector primario, que hoy en día debe hacer frente a desafíos como enfermedades emergentes y el cambio climático. En definitiva, la bioinformática aporta una visión basada en evidencias que permite tomar decisiones informadas y reducir riesgos económicos.

 

A diferencia de otros investigadores que se centran en una sola especie o área, tu trabajo es transversal. ¿Cómo ayuda el análisis de datos masivos a que proyectos de áreas tan distintas avancen con mayor precisión?

Esa transversalidad es una de nuestras mayores ventajas. Aunque los proyectos traten temas distintos, como la resistencia a enfermedades en ganado o la mejora de variedades vegetales, los métodos analíticos suelen ser los mismos: detección de patrones genéticos o modelización predictiva. Al aplicar análisis de datos de forma compartida, reutilizamos flujos de trabajo y experiencia acumulada, acelerando los proyectos, reduciendo tiempos de desarrollo y evitando que trabajemos de forma aislada, ya que los aprendizajes de un área se ponen en práctica rápidamente en otra.

 

¿De qué manera esta disciplina permite que nos adelantemos a los problemas incluso antes de que se manifiesten de forma crítica en el campo o en las granjas?

Nos ayuda a pasar de una respuesta reactiva a una estrategia preventiva. Mediante el análisis de datos genéticos y ambientales, identificamos señales tempranas como la aparición de nuevas variantes de patógenos o cambios en los microbios del suelo. Estos indicadores funcionan como sistemas de alerta precoz. Nos permiten anticipar brotes de enfermedades o problemas de adaptación al clima e intervenir mediante medidas de manejo o selección de variedades resistentes antes de que el impacto sea grave.

 

Hoy en día generamos una cantidad ingente de información biológica. Como experto en la gestión y procesamiento de estos datos, ¿cuál es el mayor desafío al que te enfrentas para que toda esa información no se pierda y se convierta en conocimiento útil para NEIKER?

El principal desafío no es el almacenamiento, sino organizar, estandarizar y garantizar que los datos sean reutilizables a largo plazo. Los datos suelen generarse con formatos y calidades muy variables. El reto está en integrarlos y documentarlos con rigor para que puedan ser analizados años después. Para lograrlo, necesitamos infraestructuras adecuadas y, sobre todo, una colaboración fluida entre los bioinformáticos y el resto del equipo investigador.

 

En un contexto de cambio climático, la gestión de datos biológicos es clave. ¿Cómo contribuye la bioinformática a predecir el comportamiento de las variedades locales?

Las bases de datos integradas nos permiten combinar información genética con datos climáticos y ensayos de campo. Con modelos de aprendizaje automático conocido como machine learning, identificamos qué partes del genoma confieren tolerancia a la sequía o al calor extremo. Esto nos permite modelizar escenarios futuros y predecir cómo responderán las variedades locales. Así, apoyamos decisiones prácticas como la conservación del germoplasma local y damos recomendaciones útiles a agricultores y ganaderos.

 

¿Cuál es el valor diferencial de aplicar la bioinformática a los retos de la agricultura y la ganadería actual?

El valor real está en hacer que la ciencia más avanzada responda a problemas reales del día a día. Transformamos datos complejos en información accionable: mejorar la sanidad animal con un uso racional de antibióticos u optimizar el consumo de agua y fertilizantes. En un territorio como Euskadi, con una orografía y clima tan particulares, la bioinformática tiene un papel estratégico. Ayuda directamente a que nuestro sector primario sea más sostenible, competitivo y esté mejor preparado para las próximas décadas.